단세포 유전체학을 이용한 유전자 발현 잡음 측정 방법 개발

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단세포 유전체학을 이용한 유전자 발현 잡음 측정 방법 개발
제안자
자문교원 김종경
연도 2017
타입 A형 과제
코스 프란시스 크릭
매칭여부
참여학생수
소개동영상

제안 배경

과제 목표

단세포 전사체 (Single-cell RNA sequencing) 데이터에서 유전자 발현 잡음 (Gene expression noise)을 정확하게 측정할 수 있는 통계적 방법 개발 및 응용 연구

과제 내용

  • 단세포 전사체의 기본 원리 이해, 데이터를 분석하기 위해 필요한 전산 프로그램 (R, Python, Linux) 및 통계/기계학습 방법론 실습
  • 단세포 전사체 분야에서 현재 사용되고 있는 다양한 유전자 발현 잡음 측정 방법 비교 분석
  • 단세포 전사체 데이터를 분석하여 유전자 발현 잡음에 영향을 미치는 기술적 잡음 (technical noise)과 교란 변수 (confounding covariates) 확인 및 이들의 영향을 최소화하는 유전자 발현 잡음 측정 방법 개발
  • 암과 개체 발생과 관련하여 생산된 단세포 전사체 데이터를 분석하여 유전자 발현 잡음이 큰 유전자 발굴 및 유전자 발현 잡음과 통계적 상관관계를 보이는 유전체 및 후성유전체 특징 동정

참고자료

희망학생