분자동력학을 이용한 베타 아밀로이드 연구

From Course@DGIST
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분자동력학을 이용한 베타 아밀로이드 연구
제안자
자문교원 최승호
연도 2017
타입 A형 과제
코스 프란시스 크릭
매칭여부
참여학생수
소개동영상

제안 배경

과제 목표

알츠하이머 질병(AD)을 유발하는 요인의 하나로 알려져 있는 베타 아밀로이드 단백질(A-40, A-42)의 물리적 특성(persistence length, stability)을 분자동력학(Molecular Dynamics) 시뮬레이션을 통해 이해하고, 기존의 원자간력 현미경(Atomic Force Microscopy) 실험을 통해 얻어진 결과와 비교한다.

과제 내용

  • 분자동력학 시뮬레이션의 기본 원리 이해, 시뮬레이션을 실행하고 결과를 해석하는데 필요한 그래픽 및 전산 프로그램(예, VMD, NAMD, LINUX, MATLAB 등) 실습
  • 원자간력 현미경을 이용한 실험결과의 이해 (김보현 교수님 데이터 활용)
  • A-40, A-42 단량체(monomer)와 이합체(dimer)의 물리적 특성 비교 (aqueous solution vs membranes 환경)
  • pH 및 지질(lipid) 성분에 따른 물리적 특성의 변화 탐구
  • 슈퍼 컴퓨팅 및 빅 데이터 처리

참고자료

희망학생