분자동력학을 이용한 G-Protein Coupled Receptors(GPCR)의 구조와 기능 연구

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분자동력학을 이용한 G-Protein Coupled Receptors(GPCR)의 구조와 기능 연구
제안자
자문교원 최승호
연도 2017
타입 A형 과제
코스 프란시스 크릭
매칭여부
참여학생수
소개동영상

제안 배경

과제 목표

분자동력학(Molecular Dynamics) 시뮬레이션을 통해, 세포 내 시그널링을 담당하고 있는 G-protein coupled receptors(GPCRs)의 구조와 기능을 이해한다.

과제 내용

  • 분자동력학 시뮬레이션의 기본 원리 이해, 시뮬레이션을 실행하고 결과를 해석하는데 필요한 그래픽 및 전산 프로그램(예, VMD, NAMD, LINUX, MATLAB 등) 실습
  • 지질(lipid)의 성분 변화에 따른 생체막과 GPCR의 상호작용 탐구
  • 리간드 결합 에너지 계산을 통해 신약 개발에 필요한 데이터 축적
  • all-atom vs coarse-grained 시뮬레이션 비교
  • 슈퍼 컴퓨팅 및 빅 데이터 처리

참고자료

희망학생